李世选是李善长的后裔，这是群臣认可的。
当年李善长被诛，并没有全家族灭，太祖特赦诸子弗诛。
他的长子李祺与临安公主的两个儿子，一个为留守中卫指挥，一个为旗手卫镇抚，后来被罢世袭。
这两人都留下了后代，子嗣曾经以恩荫担任知县、州判。
可以说，李家虽然败落，和有爵位的功臣后裔不能比，但是仍属于官宦之家，能以恩荫入仕。
后裔也颇为繁茂，李世选就是其一。
确认他的身份后，朱由检道：
“伪造敕书，该当如何定罪？”
署理大理院掌院的张九德道：
“凡诈为制书、及增减者，皆斩。”
“未施行者，绞。”
“李世选所拿敕书为伪，当以未施行判绞。”
朱由检微微点头，说道：
“那就如此定罪吧！”
“此案也不必大张旗鼓审判，以免引起物议。”
又向群臣问道：
“李世选是功臣后裔、又是公主之后，当在八议之列。”
“他犯的罪是否属于十恶，能不能够减罪？”
八议有议亲议故议贵等条款，符合条件者犯罪需要奏闻，交由皇帝裁决。
李世选的身份，这些都能勉强够得上。只要他犯的不是十恶不赦之罪，就能取自上裁，由皇帝予以赦免。
韩想到皇帝之前要把李世选交给贵族法庭审判，有些明白了皇帝的意思，回道：
“八议之五曰议能，谓有大才业，能整军旅，治政事，为帝王之辅佐，人伦之师范者。”
“李善长与太祖同心，出万死以取天下，曾被誉为勋臣第一。”
“臣以为可以议能。”
其他臣子闻言，纷纷予以附和。
他们对李善长大多同情，赞同皇帝减免李世选的罪过。
毕竟作为臣子，哪个不希望自己的后裔，能够被皇帝减免罪过呢？
李世选的敕书就算是伪造的，也称不上谋反危害社稷。他的这种行为，不在十恶之列。
朱由检见到群臣的态度，微微点了点头，决定道：
“既然如此，就以八议的议亲，赦免李世选的死罪。”
“不过他伪造敕书，不惩戒不足以威慑天下，判他流放海外，终身不得踏入中原一步。”
定下了对李世选的处置，朱由检见群臣对李善长大多有同情之意，又问道：
“朕在先前定下紫阁功臣时，命礼部和太常寺厘定太祖功臣和成祖功臣名单，在南京和北京分别建立功臣庙。”
“此事进展如何，有结果了没有？”
礼部尚书温体仁道：
“臣按陛下旨意，把有功之臣尽量列入功臣庙。”
“太祖功臣庙正殿六人：中山武宁王徐达、开平忠武王常遇春、岐阳武靖王李文忠、宁河武顺王邓愈、东瓯襄武王汤和、黔宁昭靖王沐英。”
“西序八人：越国武庄公胡大海、梁国公赵德胜、巢国武壮公华高、虢国忠烈公俞通海、江国襄烈公吴良、安国忠烈公曹良臣、黔国威毅公吴复、燕山忠愍侯孙兴祖。”
“东序七人：郢国公冯国用、西海武壮公耿再成、济国公丁德兴、蔡国忠毅公张德胜、海国襄毅公吴桢、蕲国武义公康茂才、东海郡公茅成。”
“此二十一人和郧国公廖永安、永义侯桑世杰，尽皆配享太庙。”
“嘉靖之时，增诚意伯刘基、营国公郭英配享。”
“臣以为此二十五人，应当尽列入太祖功臣庙。”
朱由检微微点头，看着群臣的目光，说道：
“此二十五人，除诚意伯刘基外，都是武将出身。”
“有没有其他功勋卓著的文臣，可以列入功臣庙？”
这句话让群臣很是欣喜，他们都是文臣，当然希望有文臣能列入功臣庙，甚至配享太庙。
再想到先前所谈李世选敕书案，这些人已经明白了皇帝的想法，韩道：
“洪武三年大封功臣，李善长位第一，制词比之萧何，褒称甚至。”
“封韩国公，岁禄四千石，子孙世袭。”
“此等功臣，臣以为当列入太祖功臣庙。”
群臣对此纷纷附和，大多认为李善长有列入功臣庙的资格。
事实上李善长被杀之后第二年，就有人为李善长辩解，太祖也未怪罪。
可以说，天下间为李善长鸣不平的大有人在，大多认为太祖对功臣太苛刻。
朱由检见群臣大多附和，也明白了他们的想法。
不过他为了维护太祖的光辉形象，当然不可能为李善长完全翻案。在扫视群臣之后，忽然道：
“众卿可知，李善长因何而死吗？”
群臣面面相觑，一时低头无语。
他们大多认为太祖是找理由杀功臣，但是在皇帝面前不好说出来。
礼部尚书温体仁揣摩皇帝意思，说道：
“李善长之罪，在于知逆谋不发举，狐疑观望怀两端，实属大逆不道。”
“故而太祖诛之，让功臣引以为戒。”
朱由检微微点头，对太祖定下的罪名当然是认可的，又向群臣追问：
“李善长时年七十七，已是风烛残年，太祖为何认为他是大逆不道呢？”
“众卿可曾想过吗？”
群臣想说太祖就是想杀功臣，但是在皇帝面前显然不能这么说。
纷纷表示不知，对这个问题没有回答。
朱由检叹息一声，说道：
“尔等想不明白也不为异，毕竟你们都是忠臣，从未想过谋逆。”
“太祖之所以杀李善长，是因为司马懿留下的教训太深刻，不得不杀之耳。”
“李善长狐疑观望，知胡惟庸逆谋而不检举，太祖一旦生病，对他自然担心。”
“为了不给后人遗祸，只能在群臣请求下将其除去。”
“否则李善长再活二十年，焉知天下姓谁？”
群臣听到这番话，内心悚然一惊，知道是皇帝的发自肺腑之语。
这个理由其实也有人猜测过，但是从皇帝口中说出来，仍旧是让人感到深深的寒意。
谁能想到，司马懿千年前所做的事情，千年后落在了李善长身上，让他落得个被杀结局――
如果没有司马懿老年篡夺权位这件事，李善长多半不会被杀。他所犯的罪过，不一定以谋逆论罪。
但是有司马懿的前例在前，太祖不敢赌这个可能。只要太祖生病身体虚弱，就会怀疑李善长的用心。
在不确定是否能熬死李善长的情况下，太祖最好的选择，就是杀掉李善长。不让这个权位很大的功臣，影响到后续皇帝。
可以说，李善长是因司马懿而死。司马懿千年前射出的一支箭，千年后射中了这个人。
想明白这件事的群臣，兔死狐悲地同时，忍不住埋怨起千年前的司马懿――
如果不是这个人谋朝篡位，皇帝何至于要杀已经致仕的老臣。
司马懿当真是遗祸千年，到现在还在贻害世人。
――
看着群臣的脸色，朱由检知道他们有些被吓到了。所以他把自己之前设立资政院的想法，向群臣道了出来：
“朕之所以设立资政院，定下致仕年龄限制。”
“就是为了使君臣相得，避免胡乱猜忌。”
“大臣年老致仕之后，只要不胡乱插手朝政，把一些人阴谋乱政的事情检举给皇帝。”
“皇帝又怎会怀疑大臣，是否有了逆心呢？”
“资政院之设，是为了君臣互信，避免有些大臣年长又有权位，让皇帝不得不痛下决心。”
这番交心的话，让群臣仍旧感到寒意，也受到一些安慰。
诚如皇帝所说，只要致仕后不胡乱插手、知道逆谋后就检举，皇帝又何必担着杀戮老臣的名声，非得把他们杀掉呢？
尤其是一些人看着皇帝年轻的面庞，感觉更是欣慰：
纵然大明的皇帝大多不长寿，当今皇帝至少也有二十年的寿命。
他们这些老臣，大多会在皇帝年老前死去。
所以，他们可以放心地建功立业，不用担心当今皇帝会杀戮功臣。
不过，也有一些人下定决心不要恋栈权位，免得皇帝觉得自己的权力太大，在生病的时候会出于担心把自己除去。
可以说，司马懿的行为，至今仍在贻害，影响君臣间的互信。
一些人因此更加感谢诸葛亮，明白了诸葛亮为何被历朝推崇的原因――
实在是大家都期望君臣相得，不希望皇帝因为一些猜忌，就胡乱杀戮君臣。
皇帝同样期望臣子有诸葛亮的忠心，对诸葛亮最开始推崇的皇帝，就是司马懿的后人司马炎。然而司马家得国不正，最终仍旧被刘裕所篡。
大明现在是没有这种权臣的，朱由检毫无顾忌地讲解了自己的看法后，又向群臣说道：
“李善长的罪过，说谋逆有些牵强，但是谁也不能确定他是否有逆心。”
“所以他的罪行不变，仍按太祖时的审判。”
“但是他的功劳也是实实在在的，应当列入功臣庙。”
“希望他成为城隍之神见了太祖后，会向太祖忏悔。”
定下这个原则，朱由检道：
“太祖功臣、成祖功臣，和紫阁功臣按同样规格封赠。”
“李善长的后裔若成功开藩，朕许其世袭伯爵之位。”
“但是李世选排除在外，他是流放罪人。”
这个处置，让刚刚身怀戒惧的群臣，感到一阵安心。
当今皇帝还是宽洪大量的，这相当于实际赦了李善长的罪。
他们商议之下，为李善长恢复了职位爵位勋级，并且追谥襄愍，有怜悯昭雪的意味。
李善长的长子李祺被追赠韩城伯，他的后裔可承袭这个爵位，前提是去海外开辟封地。
李善长的后面，又有太祖封爵不受的朱升、姑孰郡公陶安、南阳郡侯叶琛、开国文臣之首宋濂、功不在诸将后的章溢这五位文臣，同样被列入功臣庙，可以配享太庙。
宋国公冯胜、颖国公傅友德，因为和李善长一样的原因被赐死，同样实际赦免。他们被追谥为武壮、武靖，后裔可承袭伯爵爵位――
这两人多有文官为他们说话，尤其是傅友德的后裔，和很多文官有交情。
董其昌的一个弟子傅廷彝，就是傅友德的后代。
接替朱燮元担任川贵五省总督的傅宗龙，同样是傅友德的后人。他是万历三十八年进士，同科有钱谦益、杨嗣昌等人。
当今晋王一系，也是傅友德女儿的后代。
可以说，傅友德的后裔颇为繁茂。早在嘉靖年间，傅友德就被建庙赐额，已经实际平反。
朱由检这次给他平反，并没有遇到多少阻力。他还把另外一些没有犯下大罪的开国功臣实际平反，允许后裔去开辟子爵、男爵领地。如果本就有世职，转为爵位时可以升一级。
没得到谥号的功臣，这次也一并补谥，给他们应得的地位。
最终，太祖功臣庙的功臣，被定为三十三人。他们也同时配享太庙，享受皇帝祭祀。
成祖功臣庙人数就更多了，但是配享太庙被严格限制。朱由检恢复了姚广孝的配享，加上张玉、朱能、王真，只有四个人配享成祖庙庭。
成祖年间封爵的，都被列入功臣庙。他们的后裔大多是贵族，仍在承袭爵位――
就是为了不让这些勋贵闹腾，朱由检也得把他们的祖先加进去。
其中因为靖难功劳列入功臣庙的，有三十三人。
随成祖南征北战封爵的，有十三人。
仁宣时期封爵、功劳却是在成祖时期立的，有三个人。
在成祖年间启用，后来被宣宗托孤的文臣，有四个人――
之前评选紫阁功臣时一直被群臣推荐的三杨，这次和胡一起被列为成祖功臣。
但是他们的功绩在成祖功臣中实在不显眼，只能排在后面。
这五十三人，就是成祖功臣。他们的后裔同样被允许海外开藩，至少拥有伯爵爵位。
实际现在大多拥有公侯伯爵位，在京城不肯往海外去。
其余紫阁功臣，这次也得到了配享太庙的荣耀，接受皇帝祭祀。
比较麻烦的是于谦，把他配享英宗庙庭显然不合适。景泰皇帝则因为没有庙号，自然也没庙庭。
最终，在朱由检的提议下，群臣给景泰皇帝上了庙号代宗，谥号也增加到十七字，符合大明皇帝身份。
景泰陵也要改建，更符合帝陵规制。
不过他在太庙中直接被放在祧庙，因为比他更往后的宪宗、孝宗，已经在祧庙里了――
实际他没在太庙寝殿里一天，就进入了后殿。
至此，厘定功臣之事，方才完全定下。
大明的太庙和功臣庙，都要随之改变。
太祖功臣、成祖功臣、紫阁功臣，构成了大明新的功臣体系。